リファレンスには載っていませんが、GetHostIPbyName_IPv6 という関数で取得することが出来ます
int GetHostIPbyName_IPv6( char *HostName, IPDATA_IPv6 *IPDataBuf ) ;
IPDATA_IPv6 構造体は以下のような定義になっています
struct IPDATA_IPv6
{
union
{
unsigned char Byte[ 16 ] ;
unsigned short Word[ 8 ] ;
} ;
} ;
よろしければお試しください m(_ _)m