フルスクリーン表示にしていないのにフルスクリーンになってるのかはわからないけど画面がブラックアウトする。
コードはこれ。(他サイトから持ってきた部分あり)

#include "DxLib.h"

// プログラムは WinMain から始まります
int WINAPI WinMain(HINSTANCE hInstance, HINSTANCE hPrevInstance, LPSTR lpCmdLine, int nCmdShow)
{
	if (DxLib_Init() == -1)		// ＤＸライブラリ初期化処理
	{
		return -1;			// エラーが起きたら直ちに終了
	}
	SetGraphMode(640, 480, 64);
	// ３Ｄモデルの読み込み
	int ModelHandle = MV1LoadModel("box.mv1");
	SetCameraPositionAndTarget_UpVecY(VGet(0, 0, -1000), VGet(0, 0, 0));
	// 画面に映る位置に３Ｄモデルを移動
	MV1SetPosition(ModelHandle, VGet(0.0f, 0.0f, 0.0f));
	// ３Ｄモデルの描画
	MV1DrawModel(ModelHandle);
	// モデルハンドルの削除
	MV1DeleteModel(ModelHandle);

	WaitKey();				// キー入力待ち

	DxLib_End();				// ＤＸライブラリ使用の終了処理

	return 0;				// ソフトの終了 
}

追記
どうやら初期でフルスクリーンだったみたいです。