実装したのがかなり昔なので私も記憶が曖昧ですが、mv1ファイルのモデルに
vmdのモーションの追加読み込みはできません
というのもDXライブラリの3Dモデルとアニメーションデータの形式と
pmx,pmd + vmd の3Dモデルとアニメーションデータの形式が異なるため、
pmx,pmd を MV1LoadModel で読み込む際に、pmx,pmdファイル名から関連する vmdファイルが
同じフォルダにあった場合は一緒にvmdファイルを読み込み、読み込み処理中で
DXライブラリ形式の3Dモデルとアニメーションデータに変換しているからです
読み込まれ変換された3Dモデルのデータには pmx,pmd のデータからは形が
変わってしまっているため、その状態で保存される mv1ファイルには
後から vmd のモーションデータを適合させることはできません
なので、恐らく mv1ファイルに後から vmd のモーションを追加読み込みした、
というのは何か記憶違いなのではないかと思います
( ここまで言っておいて、過去のバージョンでは実際に mv1ファイルに
vmdモーションを追加読み込みできた、という場合は、すみません m(_ _;m )