classes.dex は Java のコードから生成されるプログラム実行用ファイルのようです
DXライブラリAndroid版では通常は Java のコードを一切使用しない NativeActivity という形態の
アプリとなっているため、この場合 classes.dex は作成されないのだと思います
ですが、Amazonアプリストアは NativeActivity のアプリに対応していないのか、想定していないのか、
『Androidアプリなら必ず classes.dex があるはずだ!』として、classes.dex がないパッケージは
正常なアプリパッケージではないと判断しているのかもしれません
こちらのページ
<DXライブラリ Android版を使用した Androidアプリで Java のコードを実行する>
https://dxlib.xsrv.jp/lecture/Android/Android_Java.html
を参考に、Javaコード付きのアプリにしていただければ classes.dex がパッケージに含まれますので、
よろしければ試してみてください m(_ _)m
( Java の関数は利用しなくても classes.dex は作成されます )